ATAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with High-Throughput Sequencing）是(shi)利(li)(li)用(yong)高活(huo)性(xing)轉座酶Tn5探究染色(se)質可接(jie)近(jin)性(xing)的(de)高通量測(ce)序技術。具(ju)體來說就(jiu)是(shi)利(li)(li)用(yong)轉座酶Tn5來捕獲全基(ji)因組范圍內開放性(xing)染色(se)質，再通過高通量測(ce)序及生物信息學分(fen)析來挖掘相(xiang)關基(ji)因和順式(shi)調控(kong)元件(jian)信息，以此探究轉錄調控(kong)相(xiang)關問(wen)題。
※ATAC-seq與RNA-seq、CUT&Tag等多組學和多技術聯合分析，獲取基因表達與上游調控元件、轉錄因子的關聯信息，解析轉錄因子靶向調控變化機制。
一站式(shi)服務：提供樣品(pin)處理、ATAC建庫、測序和(he)分析(xi)的全(quan)套服務。
新鮮或(huo)凍存動(dong)物組織樣本：≥100mg。
技術流程
實測數據
經典案例
自然殺傷細胞中全局細胞因子信號網絡的解構：
利用(yong)信(xin)號轉導因(yin)(yin)(yin)(yin)子(zi)(zi)和(he)轉錄激活蛋白（STAT）的細胞(bao)(bao)因(yin)(yin)(yin)(yin)子(zi)(zi)信(xin)號轉導對于(yu)自然(ran)殺傷（NK）細胞(bao)(bao)的最佳抗病毒反應至(zhi)關重要(yao)。采用(yong)了ATAC-seq、RNA-seq和(he)ChIP-seq多組學方法解構和(he)重建NK細胞(bao)(bao)中多種細胞(bao)(bao)因(yin)(yin)(yin)(yin)子(zi)(zi)信(xin)號通(tong)路的復(fu)雜互作(zuo)，發現促炎細胞(bao)(bao)因(yin)(yin)(yin)(yin)子(zi)(zi)和(he)穩(wen)態細胞(bao)(bao)因(yin)(yin)(yin)(yin)子(zi)(zi)形成協(xie)同軸，共同調(diao)節整體基因(yin)(yin)(yin)(yin)表(biao)達并進(jin)一步抑(yi)制由(you) I 型(xing)干(gan)擾(rao)素信(xin)號傳導誘導的表(biao)達，這些(xie)細胞(bao)(bao)因(yin)(yin)(yin)(yin)子(zi)(zi)通(tong)過STAT蛋白和(he)集體信(xin)號介導不同的表(biao)觀遺(yi)傳調(diao)控模式，最佳地概(gai)括了全局抗病毒反應。
參(can)考(kao)文獻(xian)：Wiedemann G M, Santosa E K, Grassmann S, et al. Deconvoluting global cytokine signaling networks in natural killer cells[J]. Nature immunology, 2021, 22(5): 627-638.
